• Višekriterijsko upravljanje vjetroagregatom, partnerstvo u istraživanjima, financiranje (MultiWind): HRZZ i Končar – Institut za elektrotehniku d.d., period 2008.-2011., glavni istraživač
• Napredne tehnike upravljanja i estimacije s primjenama u energetici i transportu, Znanstveni program financiran od strane Ministarstva znanosti, obrazovanja i športa Republike Hrvatske, period 2007.-2011., voditelj programa
• Istraživanje i razvoj sustava mikroprocesorskog upravljanja električkim strojevima i srodnim brzim procesima, korporacijski program tvrtke Rade Končar, a financijski poduprt od Saveznog sekretarijata za razvoj u bivšoj Jugoslaviji, br. projekta 376, period 1987.-1990., glavni koordinator
• Istraživanje i razvoj sustava za optimiranje, vođenje i upravljanje postrojenja “letećih škara”, projekt realiziran u Elektrotehničkom institutu Rade Končar za RMK Zenica, period 1984-1988, (projekt je financirao SIZ za znanstveni rad Hrvatske kao “izrazito prioritetno istraživanje” u periodu 1982-1984.), odgovorni projektant
• Sustav za nadzor i upravljanje vjetroagregatom, financiranje: Končar – Institut za elektrotehniku d.d., period 2004.-2009., voditelj projekta
• Modelling, Estimation and Control of Automotive Systems with Friction, financiranje: Ford Motor Company, Deaborn, SAD, 2000.-2003., voditelj projekta
• Solar Irradiance, Wind Speed and Wind Turbine Models for Design and Control of Hybrid Power Systems, United Technologies Research Center,  period 2009.-2010., voditelj projekta
• AEOLUS – Distributed Control of Large-Scale Offshore Wind Farms, EU FP7 Cooperation, STREP projekt, FP7-ICT-2007-2, period 2008.-2011., koordinator radnog paketa
• Advanced Control Techniques in Electromechanical Systems, Joint project with Professor Istvan Nagy, Department of Automation and Applied Informatics, Budapest University of Technology and Economics, period 2007.-2008., koordinator projekta s hrvatske strane
• Computationally Efficient Robust Model Predictive Control, Joint Research Project with Professor Manfred Morari from ETH Zürich, Switzerland, financiranje: Swiss National Science Foundation, 2001.-2004., koordinator projekta s hrvatske strane

• Analiza i sinteza sustava automatskog upravljanja
• Napredne metode upravljanja i estimacije
• Elektromotorni pogoni i elektromehanički sustavi
• Obnovljivi izvori energije i mikromreže
• Pohrana energije

• IEEE, senior member
• Hrvatsko društvo za komunikacije, računarstvo, elektroniku, mjerenja i automatiku – KoREMA
• International Federation of Automatic Control – IFAC
• IEEE PEMC, member of Council
• Znanstveno vijeće za tehnološki razvoj HAZU-a

• Godišnja nagrada „Hrvoje Požar“ za značajnu stručnu i znanstvenu djelatnost u razvitku energetike, 2019.
• Nagrada za životno djelo „Moć znanja“ Akademije tehničkih znanosti za cjelokupan znanstveno-istraživački rad u području tehničkih znanosti i za višegodišnji doprinos napretku struke, s osobitim naglaskom na primjenu rezultata istraživačkog rada, 2018.
• “Godišnja državna nagrada za znanost”, za značajno znanstveno dostignuće, za istraživanje naprednih strategija upravljanja i estimacije u složenim tehničkim sustavima, 2007.
• “Fran Bošnjaković” Sveučilišta u Zagrebu, za osobite zasluge razvoja i promicanja automatike kao temeljne grane u području tehničkih znanosti te za odgoj mladih stručnjaka u području automatike, 2009.
• “Zlatna plaketa Josip Lončar” FER-a za svekoliko unaprjeđenje nastave, znanstvenoistraživačkoga rada i organiziranja fakulteta, 2005.

Nedjeljko Perić – FER